El plan de los estudios de Maestría en Ingeniería Mecatrónica consta de cuatro asignaturas básicas, cuatro asignaturas optativas, tres seminarios de investigación y una tesis.
Las asignaturas se distribuyen en cuatro semestres, de acuerdo con el siguiente mapa curricular:
Las asignaturas optativas serán elegidas en común acuerdo entre el Comité Tutorial y el estudiante tomando en cuenta los conocimientos teóricos y competencias necesarias a desarrollar para la realización del proyecto de tesis, pudiendo elegir como optativa alguna asignatura considerada básica en el catálogo de asignaturas. El número total de créditos a cubrir por un estudiante son 100. El valor en créditos de las asignaturas del programa se puede apreciar en la siguiente tabla:
En caso de que un estudiante desee voluntariamente cursar otra u otras asignaturas optativas que considere convenientes para su formación, deberá contar con el aval de su Comité Tutorial, quien velará principalmente por la conclusión en tiempo y forma del proyecto de tesis sin afectación de la eficiencia terminal. En esta situación, la asignatura no se deberá registrar al alumno en su carga académica y sólo será expedida una constancia.
Las asignaturas optativas deberán ser seleccionadas a sugerencia del director de tesis y con asesoría del tutor, tomando en cuenta el tema de investigación de tesis y la línea de generación y/o aplicación del conocimiento (LGAC) a la que pertenece.